En la diputación de Los Puertos abundan los restos arqueológicos referidos a períodos prehistóricos y antiguos. Los yacimientos se encuentran concentrados en las zonas montañosas y en la costa litoral de Isla Plana. La Historia documentada de la diputación comienza en el siglo XVI, si bien en las referencias siempre se unen las descripciones de parajes y poblaciones de diputaciones vecinas, ya que hasta entrado el siglo XIX no se delimitarían en el ámbito administrativo. El desarrollo de redes hidráulicas para aprovechar los manantiales de agua naturales y la promoción de los baños termales de La Marrana marcarían la prosperidad de la zona durante finales del XIX y principios del XX.
Historia de Los Puertos