En un recorrido por los Espacios Naturales y Paisajes Protegidos del Mar Menor y dependiendo la estación del año, se pueden localizar las siguientes especies de flora y fauna:
MAR ABIERTO E ISLAS
Fauna: Zampullín, serreta, gaviota reidora y argéntea, cormorán moñudo, martín pescador, etc.
PLAYAS Y ARENALES
Fauna: Charrán, charrancito, garza real, garceta, chorlitejo, archibebe, correlimos menudo, vuelvepiedras, tarro blanco, somormujo, pato nadador, etc.
Flora: Salicornia, siempreviva, limonium, barrón, lirio, etc.
SALINAS Y HUMEDALES
Fauna: Polla de agua, flamenco, cigüeñuela, aboceta, charranes, garzas, tarro blanco, etc.
Flora: Taray, carrizo, Salicornia, bolaga, albardín, junco, etc.
ZONAS DE CULTIVO DEL HOMBRE
Fauna: Conejo, tarro blanco, culebra bastarda, culebra de escalera, lagartija colirroja, erizo común, musaraña, topo, ratón de campo, salamandra común, calandria, lavandera boyera, mirlo común, estornino negro, mochuelo común, golondrina, avión, gorrión, tórtola, collalba, abubilla, etc.
ACANTILADOS Y ROQUEDALES
Fauna: Gaviota, paloma bravía, carnícalo, etc.
Flora: Uña de gato, margarita marina, castañuela, etc.
MONTE BAJO
Fauna: Liebre, conejo, perdiz roja, codorniz, lagartija ibérica, zorro, culebra bastarda, culebra de escalera, erizo común, etc.
Flora: Higuera, algarrobo, carrasca, cornicabra, jara, mosquera, cambrón, cantueso, etc.
PINARES
Fauna: Mochuelo común, tórtola, etc.
Flora:Pino mediterráneo, pino carrasco, encina, ciprés de Cartagena o sabina mora, palmito, etc.
CUMBRES Y CRESTAS
Fauna: Halcón peregrino, águila perdicera, mariposas, etc.
Flora: Romero, tomillo, cantueso, lavanda, jara, rabo de gato, ruda, etc.